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Apr 22, 2024

デジタル PCR スタートアップ Enumerix の Ultra

ニューヨーク – ゲノミクス業界のオールスターチームによる新しいデジタル PCR 会社、Enumerix は、1 回あたり 3,000 万個の液滴を生成できる低コストのデジタル PCR 法でステルスモードから抜け出しました。

ニューヨーク – ゲノミクス業界のオールスターチームによる新しいデジタル PCR 会社、Enumerix は、反応ごとに 3,000 万個の液滴を生成できる低コストのデジタル PCR 法でステルスモードから抜け出し、現在よりもダイナミックレンジを大幅に拡大しました。テクノロジー。

Ultra-dPCRと呼ばれる同社は、来年末までにこの方法に基づく商用製品を発売する予定で、当初は研究市場と非侵襲的出生前検査市場に焦点を当てていた。

同社は自社の技術を次世代シークエンシングのようなものとして推進しており、広いダイナミックレンジの概念実証として、染色体 13、18、21 の合計 222 座を検出する NIPT アッセイを開発しました。シングルチューブのワークフロー。

Enumerix は、かつて単一細胞分析会社 Cellular Research で一緒に働いていたトリオ、Stephen Fodor、Christina Fan、Ari Chaney によって 2019 年に設立されました。

このチームは、ゲノミクス分野でいくつかの優れた真の成果を上げています。 フォーダー氏は以前、1992年にアフィメトリクスを共同設立しており、ファン氏はスティーブン・クエイク氏とともにNIPTの共同発明者として知られている。 Chaney、Fodor、Quake は 2011 年に Cellular Research を共同設立しました。同社は 2015 年に単細胞研究のための広範なゲノミクス戦略の一環として Becton Dickinson に買収され、Affymetrix は 2016 年に Thermo Fisher Scientific に 13 億ドルで買収されました。

エヌメリックス社のゼネラルマネージャー、アーロン・ソロモン氏はインタビューで、チームは「セルラー・リサーチで大きな成功を収め、とても楽しいと判断し、もう一度やりたいと思った」と語った。

Enumerix デジタル PCR 法はマイクロ流体工学を必要とせず、標準的な実験室機器と組み合わせた安価な消耗品を使用します。

ソロモン氏によると、液滴発生器は細孔のあるプラスチック製の装置だという。

この部分は、標準的な 200 マイクロリットルのチューブ ストリップに適合します。 サンプルは、Enumerix 独自のエマルジョン物質とともにロードされ、次にチューブストリップがアダプターにロードされ、標準的なラボ用遠心分離機に挿入できるようになります。

「20分間回転すると、遠心力によって飛沫のシャワーヘッドが生成され、それがPCRチューブに入ります」と同氏は語った。

同社のエマルション化学は、液滴がチューブの底に沈むように設計されており、標準的なサーマルサイクラーでより効率的に加熱および冷却できるようになりました。 また透明なので、同社独自のライトシートスキャナー機器を使用してチューブの 3D イメージングを実行することも簡単です。

パーティションの数が増えると、他の方法と比較して検出のダイナミック レンジが増加します。 ソロモン氏は、この反応にはデッドボリュームがゼロで、他の技術に比べて4倍の量のサンプルをロードできるため、どちらも感度を高めることができると述べた。 これは、リキッドバイオプシー用途など、希少分子の検出において特に重要となる可能性があります。

今週の分析化学で説明されているように、イメージング機器はエマルジョン液滴の 500 フレームをサンプリングし、これらをコンパイルして PCR チューブの 3D 再構成を生成します。 次に、カスタム ソフトウェアがパーティションを定義し、蛍光液滴をカウントします。

ライトシートは現在 4 色を検出するように構成されており、ソロモン氏は、同社は組み合わせ手法を使用して 1 回のアッセイで 12 個のターゲットを簡単に検出できると述べた。 「それを超えるためには、他の工夫もできる」と彼は言う。

全体の実行時間は 48 個のサンプルを処理するのに 2 時間で、ワークフローは自動化にも適しています。

ソロモン氏は、サンプルあたりの消耗品の総コストは 10 ドル未満であると述べました。 Enumerix は、消耗品、読み取り装置、チューブを画像化するための独自のソフトウェアを商品化する予定であり、Light Sheet スキャナのコストは「デジタル PCR 分野で市場に出ている他のスキャナと同程度」であるとソロモン氏は述べた。

他の機器は 4 対数のダイナミック レンジで動作しますが、ソロモン氏は、Ultra-dPCR はその範囲を最大 2 対数拡張すると述べました。 「これは、追加の感度を提供できることを意味し、適切な検出濃度に滴定する必要がありません」と彼は言いました。